Синсенгуми в переводе – «Новый отряд».
Название это отряд, до того бывший Мибу Росигуми и официального статуса не имевший, получил 30 сентября (18 августа – л.к.) 1863 года. В этот день состоялось изгнание из столицы самураев клана Тёсю, которые планировали украсть императора и заставить его изгнать из страны иностранцев и уволить подписавшего с ними соглашения сегуна. Мацудайра Катамори, покровитель Мибу Росигуми, добился для отряда официального статуса и привлек их в тот день к охране дворца. О создании Синсенгуми существовал личный указ императора.
В обязанности Синсенгуми входило поддержание порядка в Киото и Осаке.
У Мибу Росигуми было три командира: Серидзава Камо, Кондо Исами и Ниими Нисики. Летом 1863 года, еще до создания Синсенгуми Ниими был разжалован Серидзавой в помощники Серидзавы. Между Серидзавой и Кондо еще со времен Росигуми были не самые лучшие отношения. Командиры недолюбливали друг друга и друг другу не доверяли.
Серидзава занимался ничем не прикрытым вымогательством денег у торговцев, любил шумно погулять. Именно Серидзаве Синсенгуми обязан прозвищем «Волки Мибу» - «Мибуро». Это была игра слов: Мибу Ро – ронины из Мибу, и в то же время «ро» по-японски значит «волк». Сначала это прозвище носило сугубо отрицательный оттенок. В конце - концов терпение Мацудайры кончилось, и он отдал приказ Кондо убить Серидзаву. 28 октября ( 16 сентября – л.к.) 1863 года Серидзава был убит. Ниими, уличенный в растрате, совершил сеппуку еще 19 октября (7 сентября – л.к.) 1863 года.
Кондо Исами остался единственным командиром Синсенгуми.
Инцидент в Икеда-я, когда Синсенгуми спасли столицу от пожара, императора от похищения, а высших чиновников бакуфу от смерти, поднял престиж отряда. Недостатка в людях уже не ощущалось.
В 1864 году в Синсенгуми приняли Ито Каситаро и его людей. Ито был идейным сторонником реформаторов, но был знаком с западной военной стратегией, что сделало его ценным человеком в глазах Кондо. Ито стал военным советником командира. В 1867 году Ито добился императорского указа о назначении себя на должность хранителя гробницы покойного императора Комея. Он забрал с собой часть людей Синсенгуми и сформировал свой собственный отряд под названием Горё Эдзи. Расстались два отряда внешне мирно, но Ито сговорился с кланом Сацума и собрался захватить штаб-квартиру Синсенгуми в Мибу и всех, кто мешает ему, – убить. Узнав об этих планах, Кондо решил опередить Ито. Он пригласил его на ужин в дом своей любовницы, а на обратном пути Ито ждала засада из Синсенгуми . Люди из его отряда были частично убиты, частично бежали и присоединились к императорским войскам.
В 1867 году все члены Синсенгуми получили звание хатамото – прямых вассалов сегуна.
В 1868 году Синсенгуми приняло участие в битве при Тоба-Фусими. В скорости после нее отряд был переформирован и получил новое название – Тимбутай.